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O12-03 : 種々の Pseudomonas 属細菌のゲノム配列に基づくオイゲノール、フェルラ酸およびバニリン酸分解系遺伝子群の解析
Posted On 20 10月 2014
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1宮崎大・工・環境応用化学
[目的] 種々の細菌から見いだされているオイゲノール(EL)、イソオイゲノール(IE)、フェルラ酸(FA)およびバニリン酸(VA)の分解経路は、途中で産生される代謝中間体が共通であり、それらの多くが植物由来の天然の芳香族化合物でもあるという特徴を有する。本講演では、種々のPseudomonas 属細菌のゲノム配列からEL、IE、FAおよびVA代謝酵素をコードする遺伝子の検索ならびに比較を行った結果について報告する。
[結果および考察] 植物の病原菌または共生菌であるP.syringae、P.stutzeri, P. fluorescensの他、複数のPseudomonas 属細菌のゲノム配列よりFAからVAへの変換に関与する保存されたFA代謝オペロンならびにVAからプロトカテク酸までの変換に関与するVA代謝オペロンとそれぞれ推定される遺伝子クラスターを確認した。最近土壌から分離されたバニリン資化性細菌Pseudomonas sp. LLC-1株のドラフトゲノム配列からは、VA代謝オペロンのみを確認した。一方、一部のPseudomonas 属細菌はELおよびIE分解能を有することが知られているが、ELまたはIEの初発酸化を行う既知の酸素添加酵素と高い相同性を示す遺伝子のin silico上での分布は極めて限定的であった。以上の結果に基づいて、Pseudomonas 属細菌のEL、IE、FAおよびVA分解系遺伝子の進化について考察した。
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