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森 宙史2,藤澤 貴智3,千葉 啓和4,山本 希1,鈴木 真也2,菅原 秀明3,内山 郁夫4,中村 保一3,黒川 顕1,2 1東京工業大学地球生命研究所, 2東京工業大学大学院生命理工学研究科, 3国立遺伝学研究所生物情報研究センター, 4基礎生物学研究所ゲノム情報研究室 ライフサイエンス研究において、知識の集積体であるデータベース(DB)は、知識の参照のみならず、新たな研究分野を切り拓く上で必須となる極めて重要な研究基盤である。ライフサイエンス研究の中でも、微生物研究は歴史も古く、これまで蓄積されたデータや知識は多様かつ膨大である。さらに、ゲノム科学の発展や新型

成澤 才彦 茨城大学農学部 生物間における共生的結びつきは、多くの生物群で見出され、互いの生物の生存・繁殖に不可欠なものとなっている。糸状菌類では、植物との共生関係はよく知られており、実際に農業場面へと利用されている。しかし、細菌との同様の関係は、一部例外を除き（例えば、Partida-Martinez & Hertweck , Nature2005）、あまり注目されていない。当研究グループでは、糸状菌類に普遍的にバクテリア細菌が共存している可能性を検証し、菌学や微生物学分野での新しい概念構築を目指している。この仮説が証明されれば、これまで糸状菌単独の能力

田岡 東1,2,Oestreicher Zachery1,山下 隼人3,福森 義宏1,2 1金沢大学理工研究域, 2金沢大学理工研究域バイオAFM先端研究センター, 3慶應義塾大学医学部薬理学教室(日本学術振興会　特別研究員 PD) 原子間力顕微鏡（AFM）は、基板に固定した試料の表面をナノサイズの探針でなぞり、試料の構造を可視化する。緩衝液などの溶液中で観察を行うことができるため、生理的条件下での生体分子の観察に用いられている。金沢大学の安藤教授らが開発した高速AFMは、探針の走査速度を飛躍的に向上させることで、生体分子の構造とその動態を高い空間時間分解能で観察

中根 大介,西坂 崇之 学習院大学　理学部　物理学科 生物は，バクテリアからヒトに至るまで自発的に運動する仕組みを細胞・組織レベルで備えており，まわりの環境などに応じて驚くほど多様なメカニズムを発達させてきた．しかし，原核生物の運動様式で，詳細なメカニズムが明らかになっているものは，バクテリアのべん毛などほんのいくつかの仕組みに限られている．本演題では，以下に挙げるような原核生物の細胞1匹の体の動かし方を光学顕微鏡下でナノメーターレベルの精度で詳細に“見る”ことで，遺伝子の類似性とは異なる新しい視点で，これらのメカニズムや環境下での役割について考えたい．１：シアノ

尾花 望1,山根 由子2,中村 幸治1,野村 暢彦1 1筑波大・生命環境, 2筑波大院・環境科学 微生物は外界の環境に応答し、様々なストレスに適応して生存している。多くの実環境中の微生物は集団であるバイオフィルムを形成することによって生育することが知られている。グラム陽性偏性嫌気性芽胞形成性のウェルシュ菌（Clostridium perfringens）は土壌中や動物の腸管内などの環境中に広く在住しており、食中毒やガス壊疽を引き起こす。近年、本菌は芽胞を形成するだけでなく、バイオフィルムを形成することによって種々のストレスに耐性を得ることが明らかとなった。我々は外

中村 仁美1 1東大院・工・都市工 近年、水道水中の残留塩素濃度の低減化が進められており、給配水系での細菌再増殖ポテンシャルの増大が懸念されている。しかし、残留塩素が消失した水道水中の微生物生態については不明な点が多い。そこで本研究では、給配水管内の環境を模擬した装置であるアニュラーリアクターを用い、管壁に見たてたクーポン上の全菌数と細菌群集構造の変化を評価した。残留塩素を除去した水道水をアニュラーリアクターに22日間連続的に通水し、クーポン上の全菌数を測定すると共に、16S rRNA遺伝子のアンプリコンシーケンシングによる細菌群集構造解析を行った。通水1日後に全

坪井 亜里沙1,2,守谷 繁春2 1日大・生物資源, 2理研 地球上には様々な資源が存在するが、その中でも持続可能かつ循環型のエネルギーとして、生態系中で循環している再生可能資源であるバイオマスが注目されている。 現在私はアマゾン川に注目した研究を行っている。アンデスから流れ出る豊富なミネラルを含むソリモエス川と、植物由来の有機物が溶け込んでいるネグロ川という全く別の成分が含まれた二本の川が合流する、この世界的に有名な生物多様性のホットスポットは、そこに棲む微生物による元素から有機化合物まで様々な物質の循環によって地球レベルで重要な生態系機能を発揮していると考えて

青木 真央1,福田 洸平2,村井 友哉1,Sanchez Zoe1,新谷 政己1,2,金原 和秀1,2 1静大院・工・化学バイオ, 2静大・創造科技院 環境微生物の多くはバイオフィルム（BF）という集合体を形成し，大気や水質の浄化に寄与している．本研究では，ビフェニル分解菌Comamonas testosteroniTK102株のBF形成機構の理解を目的とした．TK102株のBF形成条件や機構を理解するためには，本菌株のゲノム情報が有用であると考え，次世代シークエンサーを用いて全ゲノム配列を決定した．また，TK102株がBFを形成するかどうか，96穴プレートとクリ

村井 友哉1 1静大院・工・化学バイオ 微生物が形成するバイオフィルム（BF）は，医療・工業の現場では除去すべき構造体であるが，体内などで形成されたBFに対して，あまり有効な除去手法はまだ見出されていない．我々は，日和見感染を引き起こす緑膿菌Pseudomonas aeruginosa PAO1株が流動条件下で形成するBFを，リアルタイムに観察する流路型デバイスを開発している．先行研究で，PAO1株にD-AA混合物を添加すると，BFは崩壊しないが，BF内部の死細胞が増加するという現象を見出している．そこで本研究では，添加したD-AA混合物のうち，どのD-AA(6種

稲葉 知大1,八幡 穣2,泉福 英信3,野村 暢彦1 1筑波大院・生命環境, 2Dept. Civil Environ. Eng., Massachusetts Inst. Technol., 3国立感染症研・細菌第1部 齲蝕の罹患者は全世界人口の30%，20億人以上にものぼり，重篤な場合，感染性心内膜炎や誤嚥性肺炎といった全身性疾患にも発展しうる疾患である．この齲蝕の原因とされるのが歯表面へのバイオフィルム形成であり，齲蝕はバイオフィルム感染症として最も良く知られた疾病である．口腔バイオフィルムは多種多様な細菌によって形成されるが，齲蝕の原因となるのはmutan