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小川 なつみ1,加藤 広海1,大坪 嘉行1,永田 裕二1,津田 雅孝1 1東北大・院生命科学 我々は、フェナントレン分解時における細菌の集団的応答を理解するため、芳香族汚染土壌からフェナントレン分解コンソーシアムを取得した。本コンソーシアムからフェナントレン分解菌としてMycobacterium sp. EPa45株が単離でき、フェナントレン分解活性は見られないものの、コンソーシアムで優占していたBurkholderia属細菌株を含むいくつかの細菌株を単離した。EPa45株とBurkholderia属細菌株の混合培養試験の結果、Burkholderia属細菌株はフ

池田 成志1,浅野 賢治1,高橋 直和2,森 清文3,富濱 毅3,海野 佑介1,信濃 卓郎4 1農研機構・北海道農業研究センター, 2サンアグロ（株）, 3鹿児島県農総セ, 4農研機構・東北農研セ, 【目的】緩効性肥料を有用共生微生物との共存を可能にする施肥技術と位置づけ、化学構造が単純な緩効性肥料であるウレアホルム型緩効性肥料（UF）の作物共生細菌群集への影響評価を行った。 【方法】北海道内の生産者圃場において生産者の慣行肥料とUFを施用してタマネギとテンサイを栽培し、収穫時期にタマネギ塊茎とテンサイ主根を採取した。これらのサンプルについて、16S rRNA遺伝

海野 佑介1,城 惣吉2,信濃 卓郎3,南澤 究4,佐伯 雄一5,池田 成志1 1農研機構・北農研, 2島根大・生物資源, 3農研機構・東北農研セ, 4東北大・院生命科学, 5宮崎大・農 ダイズのRj遺伝子群は根粒菌との相互作用に重要な役割を持つことから、長年にわたり研究されてきた。一方で、植物表面や内部にはエピファイトやエンドファイトと呼ばれる多様な微生物群が生息し植物と密接な関係を持つが、Rj遺伝子群がこうした微生物群に与える影響の実態は明らかとなっていない。そこで本研究では、Rj遺伝子型の異なる12種のダイズ品種・系統を用い、部位別に細菌群集構造解析を行うこ

鶴丸 博人1,大久保 卓1,岡崎 和之2,橋本 萌1,柿崎 芳里1,半澤 栄子1,高橋 宙之2,浅野目 謙之3,田中 福代4,関山 恭代5 1東北大・院生命科学, 2北農研, 3山形県農総研セ, 4中央農総研セ, 5食総研 テンサイ主根に共生する細菌が持つ植物生育促進因子を調査するため、テンサイ共生細菌のメタゲノム解析を行った。調査した植物生育促進因子に関わる機能性遺伝子の中で、リン酸溶解能に関わるglucose dehydrogenaseの検出頻度が最も高かった。次に、メタノール利用性（methanol dehydrogenase）や病害抵抗能に関わる遺伝子（β

青木 誠志郎1,伊藤 元己1,2,岩崎 渉2 1東大・院・総合文化・広域科学, 2東大院・理・生物科学 共生窒素固定に必須な根粒菌はαおよびβプロテオバクテリアに知られているが、その起源は今まで、農作物のマメ科植物の多くに着生するαプロテオバクテリアと考えられてきた。また根粒形成(nod)遺伝子群は分子遺伝学的に発見されたものの、その起源と共生機能獲得に至る分子進化については、ほどんど解析されて来なかった。我々はまず比較ゲノム解析により、根粒形成起源についての情報をもちうる遺伝子を計算推定したところ、nod遺伝子群と窒素固定遺伝子群の一部が、根粒菌全遺伝子の中から

菅原 雅之1,2,Epstein Brendan1,Young Nevin1,Tiffin Peter1,Sadowsky Michael1 1ミネソタ大, 2東北大・院生命科学 根粒菌はマメ科植物に根粒を形成し、共生窒素固定を行う土壌細菌である。この共生相互作用において、根粒菌が分泌するリポキチンオリゴ糖（Nodファクター）の構造の違いにより宿主範囲がある程度決定されているが、根粒菌の分泌タンパク質もまた宿主特異性および共生成立に関与することが明らかとされてきている。しかし、これまでにSinorhizobium（Ensifer）属根粒菌とMedicago属植物の

横山 正,中村 紘之,大津 直子 1農工大 根圏微生物がダイズの根粒着生数に与える影響の実態は不明である。そこで、異なるダイズ品種を日本各地で栽培し、根面と根内から土壌微生物を単離後、コロニーの色や形態等の違いに基づき150株を選抜した。次に、ダイズが元来持っている根粒を過剰に着生させない特性（根粒着生を抑制する機構）が欠損している根粒超多着生変異体ダイズ（Nod1-3）を滅菌培地で発芽させ、上記の株から79株に関して、それら土壌微生物を別々にNod1-3の根圏に先行接種し、1週間後にダイズ根粒菌USDA110株を接種後、約2週間栽培した。その後、各土壌微生物の先

浜崎 恒二1,金子 亮1,荒井 渉2,豊田 敦3,藤山 秋佐夫3,本多 牧生2,高見 英人2 1東大・大気海洋研, 2JAMSTEC, 3国立遺伝研 西部北太平洋海域は，世界でも有数の漁場であり，活発な生物ポンプ作用による二酸化炭素吸収海域でもある．本研究では，西部北太平洋の亜寒帯（K2：47N, 160E）及び亜熱帯（S1：30N, 145E）海域に設置された時系列観測点において，微生物群集代謝機能の網羅的解析を行い，この海域の物質循環と生態系を理解するための最も基本的かつ重要な情報を得ることを目的とした．2010～2011年4回の「みらい」航海にて表層海水を採

星野 辰彦1,2,諸野 祐樹1,2,寺田 武志3,稲垣 史生1,2 1JAMSTEC・高知コア研, 2JAMSTEC・海底資源研究開発セ, 3マリンワークジャパン 地球表層の７割を占める海底下環境は、2.9 x 1029もの微生物細胞が存在すると試算される地球上最大の生物圏である。しかし、それらの微生物の生態や機能については未知な点が多い。現在、高知コア研究所には科学海洋掘削により世界各地で採取された300以上の凍結掘削試料が保管されている。本研究では、これらの試料を海底下堆積物をターゲットに開発した最新の手法で分析し、海底下生命圏の量、多様性、機能の空間的分布を

Kashima Hiroyuki1,Regan John1 1Department of Civil and Environmental Engineering, The Pennsylvania State University, University Park Bioelectrochemical systems (BESs), which have the potential to couple wastewater treatment with renewable energy production, are beginning to be designe